Poznawanie ewolucji- opracowanie

Nasza ocena:

5
Pobrań: 98
Wyświetleń: 924
Komentarze: 0
Notatek.pl

Pobierz ten dokument za darmo

Podgląd dokumentu
Poznawanie ewolucji- opracowanie - strona 1 Poznawanie ewolucji- opracowanie - strona 2 Poznawanie ewolucji- opracowanie - strona 3

Fragment notatki:

POZNAWANIE EWOLUCJI Rodzina molekularna - członkowie mają wspólne cechy np. człowiek i szympans. Żeby to wykryć porównuje się też budowę przestrzenną. Rybonukleaza bydlęca - budowa 3D - bardzo podobna do rybonukleazy człowieka. Nie jest to zaskakujące xD ale np. już taka angiogenina, która stymuluje tworzenie naczyń krwionośnych również jest podobna do rybonukleaz. I obie zalicza się od tej samej rodziny białek, więc musiały mieć wspólnego przodka.
Niestety oznaczono struktury przestrzenne niewielkiej liczby białek. ;( SOOO SAD ;( ale jest dostępnych dużo sekwencji genów i odpowiadające im aminokswasy. Pokrewieństwo ewolucyjne pojawia się także w sekwencjach aminokwasów. Np. bydlęca rybonukleaza i angiogenina są w 35 % takie same. W tym rozdziale każdą nam się przyglądać metodom porównywania sekwencji AK i wnioskowania o ewolucyjnym pokrewieństwie xD
Metody porównywania sekwencjii stały się potężnym narzędziem nowoczesnej biochemii. Porównuje się też sekwencje przestrzenne, bo czasami mówią więcej niż normalne.
Jak se sekwencjonujemy to też możliwa jest ustalenie kiedy jakaśtam ewolucja zaszła. Tak się konstruuje drzewa ewolucyjne od Archea i Bacteria przez Eukarya z człekiem wlącznie. DNA pochodzące ze skamieniałości można powielać techniką PCR i sekwencjonować. ____________________________________________________________________________________
6.1 Cechy homologiczne pochodzą od wspólnego przodka
Badania ewolucyjne - w jaki sposób białka, inne cząsteczki i szlaki biochem. zmieniały się w czasie. Homologia -podst. związek pomiędzy 2ma jednostkami, cząsteczki homologiczne - pochodzą od jednego przodka. Cząsteczki homologiczne można podzielić na dwie klasy: 1) Paralogi homologi w obrębie jednego gatunku, mają często różne funkcje biochem 2) ortologi homologi w różnych gatunkach, spełniają podobne lub identyczne funkcje biochem. PODOBNO GÓWNO PRAWDA XD
Homologia często przejawia się znacznym podobieństwem w sekwencji nukelotydowej lub aminokwasowej i niemal zawsze objawia sięw strukturze przestrzennej.
____________________________________________________________________________________
6.2 Analiza statystyczna przyrówań sekwencji może wykryć homologię.
2 podobne sekwencyjnie cząsteczki - wspólne pochodzenie ewolucyjne, taką samą strukturę 3D, funkcje i mechanizm działania. Żeby wykazać homologię, moża by było też DNA porównywać, ale one mają kwasów tylko 4. A AK jest 2, więc jest bardziej szczegółowe. W celu zilustrowania metod porównawczych sekwencji będą rozważać klasę białek - globuliny. Mioglobina - białko wiążące tlen w mięśniach, hemoglobina - białko przenoszące tlen we krwi. Oba mają grupę hemową, organiczną cząst. zawierającą żelazo, która wiąże tlen. Każda cząst. hemoglobiny składa sie z 4rech łańcuchów polipeptydowych, zawierających: hem (po 2 identyko łańcuchy :alfa i 2 beta).Biorą tylko alfę i zamierzają sprawidzić podobieństwo jego do mioglobiny. Alby wykryć to podobieństwo opracowano metody przyrównania sekwencji.

(…)

… sekwencji łąńcuchów: zawiera 23 identyczne reszty AK, rozrzucone wzdłuż środkowej części sekwecji. Inne dobre - 22 identyko. ale są usytuowane bliżej końca aminowego. Obie sekwencje można tak dopasować, aby zachować większość z identycznych pozycji występujących w obu przyrównaniach. Konieczne jest jednak wstawienie przerwy do jednej. Trza je wstawiać w celu kompresjonowania tych insercji lub delecji…
… i leghemoglobiną z łubinu jest ledwie wykrywalne na poziomie sekwencji. a ludzkiej leghemoglobiny (łań. alfa) z leghemogl. łubinu nie jest statystycznie istotne (15.6% identycznych AK). Podobieństwo budowy silnie wskazuje, że struktura wiążąca gr. hemową i ułatwiająca odwracalne wiąz. tlenu pozostała zachowana w ciągu długiego czasu ewolucji. Porównanie przestrzenne daje często zaskaujące wyniki. np. aktyna
… aktywne chymotrypsyny i subtylizyny sa znacząco podobne pod względem budowy. Reszty Ser,His i Asp są rozmieszczone tak samo. Nie jest to przypadkowe, bo wykorzystują one ten same mechanizm hydrolizy wiąz. peptydowego. Może to sugerować, że są homologami, ale różnice w budowie są ogromne. Chymotrypsyna jest zbudowana ze struktur beta, subtylizyna zawiera rozległe rejony zbudowane z helis alfa. Te 3…
… na produkowaniu dużych populacji cząst., a następnie selekcjonowaniu puli pod względem okreslonych właściwości biochemicznych.
Starożytny DNA można czasami amplifikowac i sekwencjonowac DNA jest bardzo stabilne, więc dobrze robi za magazyn info genetycznej. Mogą przetrwac kilka tysięcy lat (odp.warunki).Od kiedy jest PCR mozna amplifikowac i sekwencjonowac. Znależli jakiegoś neandertalczyka sprzed 30K-100K…
... zobacz całą notatkę

Komentarze użytkowników (0)

Zaloguj się, aby dodać komentarz