To tylko jedna z 3 stron tej notatki. Zaloguj się aby zobaczyć ten dokument.
Zobacz
całą notatkę
Markery molekularne
Markery DNA- pula testów opartych bezpośrednio na cechach kwasów nukleinowych.
Umożliwiają charakterystyke organizmu na poziomie jego genomu- proteomu (np. obecność/ brak jakiegoś genu lub białka, występowanie jakiejś szczególnej jego postaci, różnice w sekwencji wybranych elementów genomu).
Wykorzystanie: m.in. ustalanie ojcostwa, kryminalistyka (identyfikacja ludzi na podstawie mikrośladów), wykrywanie genów zmutowanych w jednostkach chorobowych, tworzenie map genetycznych, wksaujących wzajemne ułożenie róznych genów w chromosomach, analizy polimorfizmów.
Fingerprinting- genetyczny odcisk palca, identyfikacja osobników przy pomocy markerów molekularnych (nawiązanie do tradycyjnej daktyloskopii).
Techniki badania zmienności DNA- wykrywanie markerów molekularnych:
RFLP- polimorfizm długości fragmentów restrykcyjnych. Wykorzystuje trawienie DNA enzymami restrykcyjnymi i elektroforezę produktów.
Zmiana pojedynczego NT w sekwencji rozpoznawanej przez enzym powoduje, że nie dokona on rozcięcia DNA
(…)
… powtarzalność.
Stosowane startery dł 16-25nt, motywie (di, tri, tetra).
Długie- wysoka specyficzność.
Amplikony- produkty reakcji 200-2000bp dł. MS jako primery. Temp annilingu 45-60st.
Tempo zmian ewolucujnych w odniesieniu do MS znacznie wyższe niż w innych typach DNA, stąd wyższy poziom polimorfizmu w tych sekwencjach.
Polimorfizm ISRR- wynik mutacji, inercji lub delecji obrębie regionu SSR. Zmiany powodują…
… spokrewnionych gatunków (ocena genetycznego podobieństwa taksonów).
Polimorfizm- wynik mutacji w obrębie sekwencji komplementarnych wobec końca 3' startera oraz drobnych delecji/ inercji między miejscami przyczepu oligonukleotydu (startera).
Wykorzystywanie metod analiz matematycznych (np. UPGMA) pozwala na graficzną ilustrację wyników uzyskanych w RAPD w postaci tzw dendrogramów (drzew filogenetycznych…
... zobacz całą notatkę
Komentarze użytkowników (0)