To tylko jedna z 6 stron tej notatki. Zaloguj się aby zobaczyć ten dokument.
Zobacz
całą notatkę
K0,5 - w kinetyce sigmoidalnej jest to stężenie substratu przy którym V0= 0,5. Vmax okresla się jako K 0,5 gdyż kinetyka ta nie jest opisywana równaniem Michealisa - Menten.
Typ K: obejmuje enzymy w których efektor zmienia K 0,5 a nie zmienia V max np. inhibitor wiąże się do miejsca allosterycznego co zmienia powinowactwo centrów wiążacego substratu do substratu,
Typ V: obejmuje enzymy w których efektor zmienia Vmax a nie wpływa na K 0,5,; w przypadku enzymów tego typu: odpowiednio zwiększają lub zmiejszają tempo rozpadu kompleksu ES na produkty,
KATALIZA KOWALENCYJNA-pod wplywem kw i zasad Lewisa (kat.nukleofilowa,elektrofilowa)bo tw jest przejsciowe wiazanie kowalencyjne miedzy ES
Zasada-nukleofil-donor pary elektonów
Kway-elektrofil-biorca pary elektronów
KATALIZA NUKLEOFILOWA-gr boczna stanowi lancuch boczny reszty aa.wystep w centrum aktywnym Ser-OH Cys-SH Asp Coo- Lys Nh2 his tyr-OH.nukleofilowa gr zlokalizowana na enz,a alektrofilow na S.1etap tw np. Acyloenz szybko=wolna rozpad na E i P. KATALIZA ELEKTROFILOWA-kowalencyjny prod.podredni tw sie miedzy kationowym ellektrofilem enz,a bogaty w e czescia substratu.enz wymaga do dzialania jonu metalu lub org kofaktorow,bo gr boczne nie sa aktywnymi elektrofilami
Elektorfil=eznym
Fosforan prydoksalu=aminotransferaza Asp
Pirofosforan tiaminy=dekarboksylaza pirogronianowa
Zn2+ = anhydraza weglanowa
OBNIZENIE DELTA G++PRZEZ ENZYMY
TABELA : OBNIZENIE DELTA H++/OBNIZENIE -TdeltaS+
*Efekt destabilizacji S(10^8) /efekt zblizenia 10^6
*odp.usytuowanie reaktywnych gr funkcjonalnych w C.A(-kat.kowalencyjna 10^10 -kat.kw-zas 10^10/ efekt orientacji 10^2
KONFORMACJA R i T
*wystepuje podczas sprzezonej(MWC)kooperacji,wszytskie podjednostki b.mają ta samą konformację.
Konformacja R-duze powinowactwo do S
Konformacja T-małe powinowactwo do S
*akt i S faworyzują konformację R
*zachowanie symetrii podczas przejscia allosterycznego
-przejscie miefzy R i T zachodzi jednoczesnie we wszytkich podjednostkach
-zw Lzwieksza prawdopodobienstwo ze wszytkie podjednostki z T w R
-zakladamy pozytywne oddzial.
L=T/Ro
„o”-przy braku L
S-wieze się tylko do R,pozytywny homotropowy
A-pozytywny efektor heterotropowy,wiąze się do R
I-negatywny efektor heterotropowy,wiaze się tylko do konf.T
Karbamoilotransferaza Asp (ATCaza)przykład
* 1 enzm szlaku biosyntezy nukleotydów pirymidowych
*hamowana przez CTP (odmienny struktutralnie od S)P koncowy
*efektory:cytodynotrifosforan CTP=all I,ATp =all *asp-S-pozytywny efektor homotropowy
... zobacz całą notatkę
Komentarze użytkowników (0)