Charakterystyka materiału genetycznego Agrobacterium Agrobacterium to rodzaj wolno żyjących, fitopatogenicznych bakterii glebowych, które atakują rośliny wnikając do nich przez zranione tkanki. W przypadku Agrobacterium tumefaciens zakażenie prowadzi do powstawania tumorowatych narośli na szyjce korzeniowej (guzowatość korzeni; ryc. 1), natomiast Agrobacterium rhizogenes wywołuje chorobę objawiającą się powstawaniem w miejscu infekcji obfitej masy tzw. korzeni włośnikowatych. Rodzaj Agrobacterium do którego należą też gatunki niepatogeniczne, zalicza się do rodziny Rhizobiaceae, wraz z licznymi gatunkami bakterii brodawkowych nawiązujących symbiozę z roślinami motylkowatymi. Agrobacterium tumefaciens: wolnożyjące bakterie glebowe, Gram (-)
pałeczkowate, orzęsione, ruchliwe
naturalne patogeny wielu roślin dwuliściennych (600gatunków)
najczęściej do transformacji genetycznej roślin wykorzystuje się: A. tumefaciens: powstanie guzowatych narośli na korzeniach A. rhizogenes : powstanie masy korzeni włośnikowatych Kolisty, zamkniety chromosom, 2,84Mpz
Liniowy chromosom, 2,08Mpz (np. Borrelia, Streptomyces)
Koliste plazmidy Ti - Tumor including (plazmid Ri w przyp. A. rhizogenes. - zawiera geny odpowiedzialne za transformację rośliny, 0,54Mpz Plazmid Ti: fragment T: zawiera onkogeny - synteza auksyn, cytokin, morfogeneza tumorów, synteza i wydzielanie opin.
Fragment T otoczony jest sekwencjami granicznymi:
Dł. 25 pz
Proste powst. nukleotydów
Integracja fragmentów T z genomem rośliny
Oprócz tego:
geny wirulencji
geny katabolizmu opin
Geny fragmentów T są zaopatrzone w sekwencje rozpoznawane przez czynniki transkrypcyjne roslin: TATA - sygnał rozpoczęcia transkrypcji; AATAAA - sygnał terminacji i poliadenylacji. Opiny są źródłem C i N dla bakterii, żyjących w przestrzeniach międzykom. Rodzaj wytwarzanej opiny jest podstawą klasyfikacji szczepów A. tumefaciens . Przykładowe opiny: oktopina, nopalina, leucynopina, agropina. Geny wirulencji (24 geny wir. ułożone w 8 operonach)
wytworzenie celulozowych włókien mocujących kom. bakteryjną do ściany komórki roślinnej
białka błonowe tworzące kanały (pilusy) umożliwiające przeniesienie T - DNA przez ścianę i błonę cytoplazmatyczną komórki roślinnej (vir B)
czynniki wycinające odcinek T (vir D)
białka chroniące i transportujące odcinek T (vir C i vir E) białka neutralizujące związki roślinne utrudniające rozwój guzów (vir F i vir H)
... zobacz całą notatkę
Komentarze użytkowników (0)