To tylko jedna z 5 stron tej notatki. Zaloguj się aby zobaczyć ten dokument.
Zobacz
całą notatkę
Dojrzewanie pre-mRNA
Tworzenie czapeczki na końcu 5'
Splicing
Poliadenylacja końca 3'
Redagowanie 1.Etapy tworzenia czapeczki
pppN (pN)n ----RNA-5trifosfataza--- ppN(Pn)+Pi (n=20-30) ppN(pN)n + Gppp(GTP) ---transferaza guanylowa---Gppp'N (Pn)n+PPi
GpppN (Pn)n + S-adenozylometionina---N^7G—metylotransferaza---m^7GpppN(Pn)n + S-adenozylohomocysteina
Zanim RNa osiągnie długośc 20-30 pnt jego koniec 5' jest chemicznie modyfikowany przez dodanie reszty 7- metyloguanozyny, powstaje struktura zwana kaptem-czapeczką
Difosforan na końcu 5' atakuje atom fosforu alfa cząsteczki GTP tworząc wiązanie 5' 5'-trifosforanowe Następnie azot w pozycji 7końcowej guaniny jest etylowany z udziłem S-adenozylometioniny powstaje kapt 0, przyległe rybozy również mogą ulegać metyzacji tworząc kapt 1 i 2 Reakcja jest przeprowadzana przez enzym zwany guanylilotransferazą
Rola czapeczki:
Zabezpiecza przed dziłąniem egzonukleaz
Ułatwia asocjację miejsca 5' splicingowego z U1 snRNA
Stanowi sygnał transportu do cytoplazmy
Stymuluje inicjację translacji
2.Splicing
Introny podzielono na 8 grup: 7 grup eukariotyczne (GU-AG, AU-AC), 1 grupa archeobakterie.
Ilość intronów wzrasta wraz z złożonością organizmu Budowa intronów GU-AG
3' miejsce akceptorowe , miejsce rozgałęzienia, które posiada adenozynę
W pobliżu końca 3' trakt polipirydynowy, region bogaty w pirymidyny
Wycinanie intronów nie jest autokatalityczne, uczestniczy 200 różnych cząsteczek białkowych Cząsteczki snRNA biorą udział w wycinaniu intronów. Te cząsteczki to:
U1, U2, NIE MA U3!!!!!!!!U4,U5,U6 snRNA -tworzą kompleksy rybonukleoproteinowe- snRNA + białka -snRNP I etap transestryfikacji Splicing rozpoczyna się od rozcięcia wiązania fosfodiestrowego między egzonem leżacym powyżej intronu ( egzon1) oraz końcem 5' intronu Grupą atakującą w tej reakcji jest 2'-OH reszty adenylowej w miejscu rozgałęzienia Między resztą A i 5'-końcowym fosforanem intronu tworzy się wiązanie 2'5'-fosfodiestrowe
Powstaje w miejscu rozgałęzienia produkt pośredni w kształcie lassa i wolny egzon 1 Ta reakcja tworzy wolny koniec 3'(3'-OH) na końcu 3' egzonu 1
II etap transestryfikacji Koniec 3'-OH egzonu 1 atakuje wiązanie fosfodiestrowe pomiędzy intronem i egzonem 2 Egzon 1 i 2 zostają połączone a intron uwolniony w kształcie lassa
Reakcja ta tworzy grupę z 5'-fosforanem egzonu 2
(…)
… się podczas pracy polimerazy II, Domena CTD na końcu polimerazy II zawiera 7 aminokwasów; CTD- (YSPTSPS)n
n=26(drożdze); (n=52mysz). W tej sekwencji są 3 seryny ale 2 ulegają fosforylacji przez czynnik transkrypcyjny
104 reszty serynowe -> mogą ulegać fosforylacji Do ogona CTD przyłańczają się cząsteczki elongacyjne Mogą oddziaływać także czynniki uczestniczące w dojrzewaniu pre-mRNA, metylotransferaza…
... zobacz całą notatkę
Komentarze użytkowników (0)