Wykład - transkrypcja u eukariota

Nasza ocena:

3
Pobrań: 343
Wyświetleń: 3612
Komentarze: 0
Notatek.pl

Pobierz ten dokument za darmo

Podgląd dokumentu
Wykład - transkrypcja u eukariota - strona 1 Wykład - transkrypcja u eukariota - strona 2 Wykład - transkrypcja u eukariota - strona 3

Fragment notatki:

Transkrypcja u Eukariota
Polimerazy RNA zależne od DNA
Polimeraza
Transkrybowane geny
Polimeraza RNA I
Geny kodujące:25S, 28S, 5,8S, 18SrRNA
Polimeraza RNA II
Geny kodujące białka, geny kodujące większość małych jądrowych RNA(saRNA, miRNA)
Polimeraza RNA III
Geny kodujące tRNA, 5SrRNA, U6-snRNA, małe jąderkowe RNA
Alfa -amanityna - wrażliwa na nią jest polimeraza II, występuje u muchomora sromotnikowego, polimeraza III wrażliwa przy większych stężeniach.
Ponad 10 jednostek. Najwieksza podjednostka skorelowana z podjednostką polimerazy bakteryjnej posiada ogon CTD. Domena terminalna zawiera 7 aminokwasów Polimeraza I-transkrybuje większość genów rRNA. Znajduje się w jąderku i jest niewrażliwa na alfa-amanitynę Polimeraza II- transkrybuje wszystkie geny kodujące białka i niektóre geny małych jądrowych RNA( snRNA) Znajduje się w nukleoplazmie i jest wrażliwa na alfa-amanitynę.
Koniec karboksylowy polimerazy II zawiera ciąg 7 aminokwasów nazwany jest karboksylową domeną CTD. Reszty serynowe i niektóre Tyrozynowe sekwencji CTD mogą być fosforylowane . Domena CTD jest miejscem związanym ze zróznicowaną aktywacją elongacji transkrypcji.
Polimeraza III- transkrybuje geny tRNA, 5S rRNA, U6snRNA oraz geny kilku innych małych RNA znajduje się w nukleoplazmie i jest stosunkowo mało wrażliwa na alfa-amanitynę Inicjacja transkrypcji poprzez polimerazę RNA I
Jednostka transkrypcyjna zawiera 3 geny w wyniku transkrypcji powstaje pierwotny transkrypt, który w wyniku dojrzewania przekształca się w 3 rodzaje dojrzałych RNA.
Promotor dla polimerazy I znajduje się przed miejscem startu składa się z :
Promotor korowy - bezpośrednio przy punkcie startu
UPR promotor 110-160, I etap:
Do elementu UPR przyłącza się czynnik transkrypcji UBF (monomeryczne białko) II etap:
Do promotora korowego przyłącza się czynnik SL1( u człowieka)- składa się z I podjednostki TBP(inicjacja polimerazy i 3 podjednostek TAFIS)
SL1=TBP+TAFIS
Reasumując w skład kompleksu polimerazy RNAI wchodzi sama polimeraza oraz cztery dodatkowe kompleksy białkowe TBP-TATA bilinding protein
TAFIS-TBP associated factors
Po związaniu 2-ch czynników przyłącza się polimeraza I tworzy się kompleks zamknięty, polimeraza rozplata tworzy się kompleks otwarty
Budowa polimerazy RNA II
Ponad 10 jednostek. Najwieksza podjednostka skorelowana z podjednostką polimerazy bakteryjnej posiada ogon CTD. Domena terminalna zawiera 7 aminokwasów

(…)

… TFIIH
TFIIH
Aktywność helikazy, odpowiedzialna za przejście kompleksu promotorowego zamkniętego w otwarty
Elongacja i terminacja transkrypcji Inicjacja transkrypcji kończy się z chwilą wytworzenia pierwszego wiązania fosfodiestrowego zapoczątkowującego syntezę RNA Początek elongacji zbiega się z fosforylacją przez czynnik transkrypcyjny TFIIH seryny 5 w domenie C-końcowej
Z rozpoczęciem elongacji…
… podstawowy dla polimerazy RNA II
Promotor zbudowany z 3 sekwencji:
Sekwencja TATA - w pozycji około 25
Inr - sekwencja inicjatorowi obejmuje miejsce startu ( punkt +1)
DPE u muszki owocowej
Sekwencje rozpoznawane przez czynnik transkrypcyjny :
Czynnik podstawowy TFIID- najważniejsza podjednostka białka TBP- rozpoznaje sekwencje TATA w pozycji -25. Dwie podjednostki czynnika TFIID rozpoznają sekwencje InR…
… w komórce w formie nieaktywnej białka, aktywowanej w odpowiednich warunkach przez fosforylację, de fosforylację
Białko nieaktywne uaktywnia się przez związanie liganda po czym wedruje do jądra
Czynnik transkrypcyjny związany z bł. Jądra proteolitycznie uwalnia domenę która wiaże się z DNA
Związany z inhibitorem w określonych warunkach w odpowiedzi na pewne sygnały- dysocjacja i uaktywnienie Inicjacja…
… odpowiednich nukleotydów w rRNA.
Cząsteczka pre-rRNA łączy się z białkami rybosomowymi tworząc olbrzymi kompleks rybonukleoproteinowy kompleks taki nazywa się proteasomem *Proces dojrzewania pre-rRNA katalizowany jest enzymatycznie, w tym również
przez rybozymy. Udowodniono (przynajmniej u jednego przedstawiciela eukariota),
że występujący w pre-rRNA u Tetrahymena termophila intron przeprowadza…
... zobacz całą notatkę



Komentarze użytkowników (0)

Zaloguj się, aby dodać komentarz