To tylko jedna z 65 stron tej notatki. Zaloguj się aby zobaczyć ten dokument.
Zobacz
całą notatkę
TRANSFERAZY EC 2....
- katalizują reakcje przenoszenia grup funkcyjnych
między cząsteczkami donora i akceptora
A-B + C → A + B-C
Wiele reakcji, w których uczestniczą transferazy, należy do
najważniejszych reakcji biochemicznych
TRANSFERAZY EC 2....
EC 2.1.-.-. reszty jednowęglowe
EC 2.1.1.-.
metylotransferazy
EC 2.1.2.-.
hydroksymetylo-, formylo- transferazy
EC 2.1.3.-.
karboksy- i karbamoilo transferazy
EC 2.1.4.-.
amidynotransferazy
EC 2.2.-.-. grupy aldehydowe lub ketonowe
EC 2.2.1.-.
transketolazy i transaldolazy
EC 2.3.-.-. grupy acylowe
EC 2.3.1.-.
grupy inne niż amino-acylowe
EC 2.3.2.-.
aminoacylotransferazy
EC 2.3.3.-.
g. acylowe przekształcane po przeniesieniu do alkilowych
2.1.1.37. DNA metylaza 5-cytozyny
S-adenozylo-L-metionina + DNA = S-adenozylo-L-homocysteina + DNA
z 5-metylocytozyną
W różnych typach guzów
mózgu stwierdza się zależność
między ilością
5Met Cyt a złośliwością guza
Centrum katalityczne Metylazy HhaI
cysteina 81
wiaże się z
C6 cytozyny
S. Kumar, i wsp., N.A.R., 1994, 22, 1-10
Struktura krystaliczna Metylazy HhaI z bakterii
Haemophilus`haemolyticus
- poznano już 36 sekwencji
metylazy DNA z różnych
organizmów – bakterii, myszy,
ludzi,
bakteryjna - 327 AA
ludzka - 1495 AA
- 10 motywów o wysokiej
zgodności (konserwowanych )
-centrum katalityczne tworzone
jest przez 6 motywów :
I-czerwony, IV –żółty, VI-zielony,
VIII-niebieski, IX-purpurowy, Xfioletowy
region rozpoznający DNA jest w
szczelinie miedzy dużą i małą
domeną
S. Kumar, i wsp., N. A. R., 1994, 22, 1-10
Struktura krystaliczna enzymu M.HhaI z bakterii
Haemophilus`haemolyticus
-region
rozpoznający DNA
(ciemnozielony)
- DNA w szczelinie
miedzy domenami
- po związaniu DNA
następuje zmiana
konformacji enzymu
– motyw IV (żółty)
przesuwa się o 25Å
w kierunku szczeliny
DNA
S. Kumar, i wsp., N. A. R., 1994, 22, 1-10
Metylacja DNA a struktura chromatyny
- metylacja większości genów
najczęściej prowadzi do wyłączenia ich
ekspresji
- zmetylowane sekwencje DNA są
rozpoznawane przez kilka
specyficznych białek
- uważa się, że te białka przeszkadzają
enzymom przeprowadzającym
transkrypcję w przyłączeniu się do
genu i w ten sposób hamują ekspresję
genu
Metylacja ma bardzo duże znaczenie ponieważ komórki mają ściśle określoną
funkcję, a do spełniania jej wykorzystują tylko część informacji zawartej w DNA.
W niektórych komórkach rakowych zaobserwowano znacznie podwyższony poziom
aktywności metylaz DNA, który prowadzi do zmian we wzorze metylacji, przez co
wyciszeniu ulegają niektóre geny.
Rodzina metylotransferaz DNA (DNMT)
w komórkach eukariotycznych wyróżniamy podgrupy funkcjonalne, które są
odpowiedzialne za różne typy metylacji.
domena regulatorowa
domena katalityczna
DNMT1
DNMT2
DNMT3A
DNMT3B
DNMT3L
DNMT1 odpowiada za dziedziczenie odpowiedniego wzorca metylacji, czyli jego
odtworzenie na nici potomnej, również posiada zdolność metylacji de novo.
Najnowsze badania sugerują, że ten enzym posiada znacznie większe
powinowactwo względem częściowo
... zobacz całą notatkę
Komentarze użytkowników (0)