Podstawy bioinformatyki - ćwiczenia 6

Ćwiczenie 06    Obliczanie  współczynnika  zaburzenia  równowagi  Hardyego-Weinberga  przy  pomocy  programu GDA    Praca samodzielna:  -  dla 20-tu osobników i 3 loci wybranych z własnego zbioru danych proszę przygotować plik  wsadowy dla programu GDA (wzór struktury pliku podano na dole)  -  proszę wykonać następujące obliczenia:    wartości  wsp.  równowagi  Hardyego-Weinberga  dla  pojedynczych  loci  oraz  par  loci    przetestować  hipotezę  o  istnieniu  równowagi  Hardyego-Weinberga  dla  pojedynczych loci oraz dla par loci    Praca wspólna:  -  interpretacja wyników, decyzja nt hipotezy  -  wymagana znajomość:    testu statystycznego, który został użyty do analizy danych    testowanych hipotez    definicji błędów związanych z testowaniem    przykładowa struktura pliku    #NEXUS  [! example 1 ]  begin gdadata;    dimensions nloci=5 npops=2 ;    format labels missing=? separator=/ ;    locusallelelabels      1 'locus 1',      2 'locus-2',      3 'locus-3',      4 'locus-4',      5 'locus-5'    ;    MATRIX    Pop_1:      _1_ 4/4 4/4 3/3 3/2 4/4      _2_ 4/4 3/3 4/4 4/3 4/4      _3_ 4/4 4/3 4/4 4/3 4/4      _4_ 4/4 4/4 3/3 3/3 4/4      _5_ 4/4 4/3 4/4 4/4 4/4      _6_ 4/4 4/4 4/4 2/2 4/4      _7_ 4/4 4/4 4/3 4/3 4/4      _8_ 4/4 4/4 4/4 4/4 4/4    ;  END;  ... zobacz całą notatkę