Podstawy bioinformatyki - ćwiczenia 4

Nasza ocena:

5
Pobrań: 35
Wyświetleń: 798
Komentarze: 0
Notatek.pl

Pobierz ten dokument za darmo

Podgląd dokumentu
Podstawy bioinformatyki - ćwiczenia 4 - strona 1 Podstawy bioinformatyki - ćwiczenia 4 - strona 2 Podstawy bioinformatyki - ćwiczenia 4 - strona 3

Fragment notatki:


Analiza sekwencji DNA Przygotowywanie danych po  sekwencjonowaniu Badane fragmenty DNA sekwencjonujemy na obu  niciach – forward oraz reverse. Ma to na celu sprawdzenie poprawności  sekwencjonowania – eliminacje błędów mogących  pojawid się podczas amplifikacji DNA Przygotowywanie danych po  sekwencjonowaniu Tworzenie sekwencji konsensusowej z obu nici  obejmuje następujące etapy: -otwieramy pliki z chromatogramami z obu nici w  programie Bioedit - wklejamy nid reverse do okienka z nicią forward - odwracamy nid reverse -przyrównujemy obie nici i nanosimy poprawki mające  na celu stworzenie jednej wspólnej sekwencji dla obu  nici Otwieramy pliki z chromatogramami z obu nici w  programie Bioedit Otwieramy pliki z chromatogramami z obu nici w  programie Bioedit Wklejamy nid reverse do okienka z nicią forward Wklejamy nid reverse do okienka z nicią forward Odwracamy nid reverse – nici forward oraz reverse są  względem siebie komplementarne i odwrócone – musimy zmienid jedną z nich aby obie miały tą samą  sekwencję Przyrównujemy obie nici Przyrównujemy obie nici Nanosimy poprawki mające na celu stworzenie jednej  wspólnej sekwencji dla obu nici ... zobacz całą notatkę

Komentarze użytkowników (0)

Zaloguj się, aby dodać komentarz