To tylko jedna z 6 stron tej notatki. Zaloguj się aby zobaczyć ten dokument.
Zobacz
całą notatkę
Regulacja biosyntezy AF jest skomplikowana i należy ją podzielić na 3 części:
regulacja wewnątrz klastra biosyntezy AF
AF to pierwszy grzybowy metabolit wtórny, dla którego opisano ułożenie genów w klastrze DNA (70kb zasad) aflS i aflR - geny regulatorowe, Identyczny klaster u A. parasiticus, flavus, oryzae
zewnętrzna kontrola klastra AF i globalna regulacja metabolizmu wtórnego
czynniki środowiskowe regulujące biosyntezę AF
Ad 2) Klastry genów metabolizmu wtórnego:
geny metabolizmu wtórnego ułożone są w klastrach
bardzo popularne
najczęściej genu regulowane są poza klastrem
położenie genów regulatorowych wewnątrz klastra na pewne implikacje
A.nidulans nie produkuje AF, ale posiada wszystkie geny i enzymy poprzedzające produkcję sterigmatocystyny (ST) -inaczej niż u A.flavus.
ta mimikra wynika z tego, ze był wspólny przodek i geny przearanżowały się do innych gatunków
Szlaki AF i ST wydaja się mieć ten sam schemat biosyntezy, aż do wytworzenia ST. Ułożenie genów w A. flavus i A. nidulans różni się. Takie przystosowanie genów, świadczy o wieku klastra (450 mln lat).
Regulatory transkrypcyjne
aflR
aflS
5.1 aflR:
gen ten koduje białko rozpoznające specyficzną sekwencję DNA - wiążącego (Zn(II)2Cys6)
niezbędne do aktywacji transkrypcji we wszystkich genach strukturalnych.
Udowodnienie, że alfR jest genem regulatorowym:
Porównano ekspresję genów w typie dzikim i z delecją aflR A. parasiticus z zastosowaniem mikromacierzy (5002 elementów)
Brak ekspresji (w przypadku 2 genów - aflR koniecznie potrzebny) lub jej spadek większości genów w szczepie w delaflR, co oznacza, że aflR jest niezbędne do ich transkrypcji - oznaczone jako strzałka w dół
6 genów ma niezależną regulację (nc - nie ma wpływu) ekspresja regulowana w inny sposób niż aflR 5.2 aflS:
geny aflR i aflS leżą blisko siebie, ale są transkrybowane w przeciwną stronę i mają niezależne promotory mogą jednak mieć wspólne miejsca wiążące dla czynników transkrypcyjnych lub innych elementów regulatorowych
Rola aflS nie jest jednoznaczna:
U szczepów z delecją aflS powstają produkty pośrednie, ale nie są przekształcane do AF
U A. parasiticus AflS wiąże się z AflR i jest niezbędne do jego aktywacji (do aktywacji białka AflS).
3 najważniejsze funkcje białek AflS i AflR:
(…)
… do podjednostki alfa białka G Cyklaza staje się aktywna, zrobi się cykliczne AMP z ATP i ono się przyczepi do PKA
Odłączają się części katalityczne, które dalej modyfikują cos innego.
Wiadomo, że istnieje ścisła zależność pomiędzy produkcją AF a stadium wzrostu.
U Aspergillus, tzw. fenotyp puszysty (grzybnia powietrzna) nie ma zdolności do produkcji AF/SM. Mutanty te u Aspergillus nidulans umożliwiły odkrycie…
… transkrypcji klastra AF
Nowy element cAMP- zależny - CRE1 (A. parasiticus).
Kontrola zewnętrzna klastra aflatoksyny - globalna regulacja metabolizmu wtórnego
Przekazywanie sygnału przez heterotrimeryczne białko G i PKA
Przekazywanie sygnału przez cAMP
Przekazywanie sygnału przez Ras i GTPazę
Rearanżacja (remodeling) chromatyny
Heterotrimeryczne białko G i PKA
Heterotrimeryczne białka G zalicza się do dużej nadrodziny białek wiążących GTP. Białka G różnią się od innych przedstawicieli nadrodziny swą trimeryczną budową. Składają się z 3 różnych podjednostek; alfa (39-45kD) - połączona z GDP, beta, gamma.
Beta i gamma tworzą trwały kompleks, gdy podjednostka alfa łatwo dysocjuje
Filmy z youtube: cAMP sugnaling
the map kinase (MAPK) signaling pathway
Kinazy białkowe PKA
Grupa kinaz, których substratami są białka…
…. Enzymy te przeprowadzają reakcję fosforylacji cząsteczki specyficznego dla danej kinazy białka. Fosforylacja zwykle prowadzi do zmiany konformacji cząsteczki białka i w konsekwencji zmiany jego aktywności, zdolności do wiązania się z innymi białkami albo przemieszczenia cząsteczki w obrębie komórki. Do 30% białek podlega regulacji na tej drodze Większość szlaków metabolicznych komórki, zwłaszcza…
... zobacz całą notatkę
Komentarze użytkowników (0)