Drzewa filogenetyczne

Nasza ocena:

5
Pobrań: 49
Wyświetleń: 875
Komentarze: 0
Notatek.pl

Pobierz ten dokument za darmo

Podgląd dokumentu
Drzewa filogenetyczne - strona 1 Drzewa filogenetyczne - strona 2 Drzewa filogenetyczne - strona 3

Fragment notatki:


Drzewa filogenetyczne Drzewa filogenetyczne Proszę wykonad drzewa bazujące na  aligmentach wykonanych w poprzednim  tygodniu, w oparciu o metody  - parsymonii - bioNJ - ML Czy są widoczne różnice w ułożeniu gałęzi na  drzewie ? Z czego te różnice mogą wynikad ? Drzewa filogenetyczne Proszę znaleźd i pozyskad z bazy NCBI sekwencje  podjednostki 2 dehydrogenazy NADH (ND2) dla 15  gatunków ssaków (po 3 sekwencje z 5 rzędów). Następnie proszę je przyrównad i stworzyd drzewa  metodami parsymonii oraz przyłączania sąsiada. Proszę wybrad model substytucji dla metody ML przy  użyciu programu jModelTest. Jaki model został wybrany ? Jakie są podstawowe  założenia tego modelu ? Drzewa filogenetyczne Przy użyciu wybranego modelu proszę stworzyd  drzewo metodą najwyższej wiarygodności. Jak grupują się poszczególne rzędy ssaków na  wszystkich rodzajach drzew ? Jakie są różnice i z czego one mogą wynikad ? Które z drzew przestawiających pokrewieostwo  sekwencji najlepiej odzwierciedla powiązania  gatunkowe ? Czy są różnice w istotnościach poszczególnych węzłów  na różnych rodzajach drzew ? ... zobacz całą notatkę



Komentarze użytkowników (0)

Zaloguj się, aby dodać komentarz