To tylko jedna z 4 stron tej notatki. Zaloguj się aby zobaczyć ten dokument.
Zobacz
całą notatkę
Drzewa filogenetyczne Drzewa filogenetyczne Proszę wykonad drzewa bazujące na aligmentach wykonanych w poprzednim tygodniu, w oparciu o metody - parsymonii - bioNJ - ML Czy są widoczne różnice w ułożeniu gałęzi na drzewie ? Z czego te różnice mogą wynikad ? Drzewa filogenetyczne Proszę znaleźd i pozyskad z bazy NCBI sekwencje podjednostki 2 dehydrogenazy NADH (ND2) dla 15 gatunków ssaków (po 3 sekwencje z 5 rzędów). Następnie proszę je przyrównad i stworzyd drzewa metodami parsymonii oraz przyłączania sąsiada. Proszę wybrad model substytucji dla metody ML przy użyciu programu jModelTest. Jaki model został wybrany ? Jakie są podstawowe założenia tego modelu ? Drzewa filogenetyczne Przy użyciu wybranego modelu proszę stworzyd drzewo metodą najwyższej wiarygodności. Jak grupują się poszczególne rzędy ssaków na wszystkich rodzajach drzew ? Jakie są różnice i z czego one mogą wynikad ? Które z drzew przestawiających pokrewieostwo sekwencji najlepiej odzwierciedla powiązania gatunkowe ? Czy są różnice w istotnościach poszczególnych węzłów na różnych rodzajach drzew ?
... zobacz całą notatkę
Komentarze użytkowników (0)