Problemy do rozwiazania

Nasza ocena:

3
Pobrań: 49
Wyświetleń: 952
Komentarze: 0
Notatek.pl

Pobierz ten dokument za darmo

Podgląd dokumentu
Problemy do rozwiazania - strona 1 Problemy do rozwiazania - strona 2 Problemy do rozwiazania - strona 3

Fragment notatki:


Problemy do rozwiązania 1. Pochodzenie człowieka W   oparciu   o   podaną   sekwencję   białka   mitochondrialnego   określ   z   jakimi   małpami  człekokształtnymi   człowiek   jest   najbardziej   spokrewniony.   Przy   wyborze   sekwencji  homologicznych wybierz sekwencje należące do naczelnych (człowieka, szympansa, goryla,  orangutana, gibbona, małp zwierzokształtnych), ssaków łożyskowych, torbaczy i stekowców  (grupę zewnętrzną). gi|17981863|ref|NP_536853.1| NADH dehydrogenase subunit 5 [Homo sapiens] MTMHTTMTTLTLTSLIPPILTTLVNPNKKNSYPHYVKSIVASTFIISLFPTTMFMCLDQEVIISNWHWAT TQTTQLSLSFKLDYFSMMFIPVALFVTWSIMEFSLWYMNSDPNINQFFKYLLIFLITMLILVTANNLFQL FIGWEGVGIMSFLLISWWYARADANTAAIQAVLYNRIGDIGFILALAWFILHSNSWDPQQMALLNANPSL TPLLGLLLAAAGKSAQLGLHPWLPSAMEGPTPVSALLHSSTMVVAGIFLLIRFHPLAENSPLIQTLTLCL GAITTLFAAVCALTQNDIKKIVAFSTSSQLGLMMVTIGINQPHLAFLHICTHAFFKAMLFMCSGSIIHNL NNEQDIRKMGGLLKTMPLTSTSLTIGSLALAGMPFLTGFYSKDHIIETANMSYTNAWALSITLIATSLTS AYSTRMILLTLTGQPRFPTLTNINENNPTLLNPIKRLAAGSLFAGFLITNNISPASPFQTTIPLYLKLTA LAVTFLGLLTALDLNYLTNKLKMKSPLCTFYFSNMLGFYPSITHRTIPYLGLLTSQNLPLLLLDLTWLEK LLPKTISQHQISTSIITSTQKGMIKLYFLSFFFPLILTLLLIT 2. Pochodzenie wielorybów W oparciu o podaną sekwencję białka mitochondrialnego określ z jakimi gatunkami lub grupą  ssaków najbardziej spokrewniona jest grupa waleni (wielorybów). Przy wyborze sekwencji  homologicznych   wybierz   inne   sekwencje   należące   do   waleni,   oraz   różnych   grup   ssaków  łożyskowych   (np.   naczelne,   parzystokopytne   w   tym   hipopotama,   nieparzystokopytne,  drapieżne,   nietoperze,   owadożerne,   gryzonie   itd.)   a   także   przedstawicieli   torbaczy   i  stekowców (grupę zewnętrzną). gi|5819104|ref|NP_006899.1|ND5_10014   NADH   dehydrogenase   subunit   5   [Balaenoptera  physalus] MNLFTSFTLLTLLILTTPIMMSHTGSHVNNKYQSYVKNIVFCAFITSLVPAMVYLHTNQETLISNWHWIT IQTLKLTLSFKMDYFSLMFMPVALFITWSIMEFSMWYMHSDPYINQFFKYLLLFLITMLILVTANNLFQL FIGWEGVGIMSFLLIGWWFGRTDANTAALQAILYNRIGDIGLLASMAWFLSNMNTWDLEQIFMLNQNPLN FPLMGLVLAAAGKSAQFGLHPWLPSAMEGPTPVSALLHSSTMVVAGIFLLVRFYPLMENNKLIQTVTLCL GAITTLFTAICALTQNDIKKIIAFSTSSQLGLMMVTIGLNQPYLAFLHICTHAFFKAMLFLCSGSIIHNL NNEQDIRKMGGLFKALPFTTTALIIGCLALTGMPFLTGFYSKDPIIEAATSSYTNAWALLLTLIATSLTA VYSTRIIFFALLGQPRFPPSTTINENNPLLINPIKRLLVGSIFAGFILSNSIPPMTTPLMTMPLHLKLTA LAMTTLGFIIAFEINLDTQNLKHKHPSNSFKFSTLLGYFPTIMHRLPPHLDLLMSQKLATSLLDLTWLET ILPKTTALIQLKASTLTSNQQGLIKLYFLSFLITITLSMILFNYPE 1 Analiza filogenetyczna w programie MEGA – sekwencje aminokwasowe 1. Poszukiwanie sekwencji homologicznych algorytmem BLAST. 1.1. Kliknij na ikonę  Align  i wybierz  Do BLAST Serach . 1.2. Wybierz algorytm  blastp . 1.3. Wklej w okno  Enter Query Sequence  sekwencję, do której poszukujesz homologów. 1.4.   Jako   przeszukiwaną   bazę   ... zobacz całą notatkę



Komentarze użytkowników (0)

Zaloguj się, aby dodać komentarz