To tylko jedna z 6 stron tej notatki. Zaloguj się aby zobaczyć ten dokument.
Zobacz
całą notatkę
PRZEPŁYW INFORMACJI U MIKROOGRANIZMÓW STRUKTURA DNA Nici antyrównoległe - o przeciwnej polarności - przekłada się na sposoby replikacji - będą replikowane w inny sposób DNA, 10% RNA, 10% białek - spermina, spermidyna (spełniają inne funkcje niż histony - spermina i spermidyna głównie funkcja stabilizująca) REPLIKACJA - POCZĄTEK - ori C - 442 nukleotydy - miejsce początku replikacji - jest to jedno miejsce, jedne widełki replikacyjne - proces replikacji zachodzi w obie strony Biegnie w dwóch kierunkach Jest to proces ciągły Po drugiej stronie biegunowo jest miejsce MODEL REPLIKACJI SEMIKOSERWATYWNEJ - wymaga separacji nici DNA - połowa nowej powstającej nici jest nicią starą, a druga jest dosyntezowana Do zakończenia procesu replikacji następuje wtedy gdy dojdzie do miejsca terminacji na drugim biegunie cząsteczki DNA
Podział komórki dopiero po podziale DNA i przyłączeniu do błony komórkowej W zależności od ilości miejsc inicjacji wydłuża się czas generacji - czas do kolejnego podziału. Jeżeli inicjacja zajdzie zanim DNA całkowicie się podzieli to czas jest znacznie krótszy. SUPERHELISA DNA Nie każda postać konformacyjna helisy znajdującej się w cytoplazmie może być replikowana. Wprowadzenie superstruktury - taka trójwymiarowa superstruktura to odpowiednio zwinięta dwuniciowe DNA Konformacja superstruktury: + - zwinięta zgodnie ze skrętem alfa-helisy - ma tendencje do zwijania się - niemożliwa replikacja - - zwinięta przeciwnie do skrętu alfa-helisy - wymaga energii do stabilizacji - kluczowa do replikacji
Superstruktura to mniej więcej 15 par zasad - jeden skręt U bakterii jest enzym - topoizomeraza - zmienia konformację przestrzenną makrocząsteczek, wprowadza odmienną przestrzenną strukturę - izomeracji ulega trójwymiarowa struktura DNA - brak zmian chemicznych - enzym hydrolizuje jedno wiązanie fosfodiestrowe ( na jednej nici) - wokół tego fragmentu może dochodzić do swobodnej reakcji - następnie to wiązanie ulega kowalencyjnemu przyłączeniu dzięki innemu enzymowi. Tą topoizomerazą jest giraza zależna od energii z ATP - może wprowadzić superstrukturę dodatnią i ujemną. Ten enzym też ma aktywność ligazową, może zatem też połączyć te nukleotydy (te których wiązanie zostało shydrolizowane) Powstawanie superstruktury 1. Stan relaksacji 2. Wprowadzanie superstruktury - struktura pośrednia - na jednym zgodnie z alfa-helisą, a na drugiej stronie rpzeciwnie do alfa-helisy (stabilizacja całej superstruktury) 3. Następnie zmiana skrętu i kowalencyjne zamknięcie superstruktury ujemnie skręconej
(…)
… superstruktury) 3. Następnie zmiana skrętu i kowalencyjne zamknięcie superstruktury ujemnie skręconej Wydłużanie nici 5' do 3' wolnego końca - energia pochodzi z hydrolizy wiązania fosfodiestrowego BIAŁKA BIORĄCE UDZIAŁ W REPLIKACJI DNA U BAKTERII BIAŁKO - SUBSTRAT - FUNKCJE ssBs (wiążące) - ssDNA - utrzymuje separację nici topoizomerazy (giraza) - dsDNA; ATP - wprowadzenie `-` superhelisy stan wysokoenergetyczny primaza (polimeraza RNA DNA-zależna) - ssDNA; rNTP (rybonukleotydy) - synteza polimeru RNA (primer) DNA polimeraza II - brak (polimeraza DNA II nie jest konieczna do normalnego wzrostu) - replikacja (odpowiedź SOS; przestawienie metabolizmu bakterii) Helikazy - dsDNA - rozwijanie nici DNA w widełkach replikacyjnych (odpowiedzialne za rozpad wiązań wodorowych, te nici stabilizuje ssBs) DNA…
… primer wydłużenie 5' do 3' primera RNA; oddysocjowanie primerazy przyłączanie dNTP do primera polimeraza DNA III polimeraza DNA I - uzupełnia luki degraduje primer kompletowanie DNA - polimeraza DNA I ligaza DNA - łączy wolne końce Widełki replikacyjne - helikazy - ssBs - primaza na nici opóźniającej; fragm. Okazaki - polimeraza DNA III na nici wiodącej
NAPRAWA DNA Przyłączenie nieprawidłowego (energia z nukleotydu w postaci trójfosforanu) i usunięcie go MODEL TOCZĄCEGO SIĘ KOŁA - umożliwia genetyczne transfery między bakteriami Zachodzi najczęściej w elementach genetycznych dodatkowych, np. plazmidach Wolny koniec 3' - nacięcie jednej nici polimeraza DNA - addycja dNTP do wolnego 3'-OH nić, która została zastąpiona ssDNA Ta wolna nić od 5' końca może być przekazywana do drugiej komórki…
… Wolna grupa aminowa z grupą karboksylową na łańcuchu polipeptydowym REGULACJA BIOSYNTEZY BIAŁEK BIAŁKA: 1. konstytutywne - białka stałe; występują stale w określonym stężeniu 2. indukowane - powstające w wyniku określonej zmiany sytuacji w komórce, np. metabolizujące laktozę ale też wiele innych KONTROLA TRANSKRYPCJI - aktywność polimerazy RNA Inicjacja transkrypcji wymaga czynnika sigma Sekwencja…
…. Gdy pojawia się laktoza i nie ma glukozy w podłożu to laktoza łączy się z tym represorem, zmienia się jego konformacja przestrzenna i nie blokuje operonu. Dodatkowo białko nośnikowe CRP łączy się z cAMP i umożliwia działanie polimerazy RNA i transkrypcję genów operonu
Regulacja biosyntezy białek - operon LAC - metabolizm laktozy - hydroliza do galaktozy i glukozy, włączany dopiero po zmetabolizowaniu glukozy…
... zobacz całą notatkę
Komentarze użytkowników (0)