Metody hodowlane - Wykład 7

Nasza ocena:

5
Pobrań: 56
Wyświetleń: 1715
Komentarze: 0
Notatek.pl

Pobierz ten dokument za darmo

Podgląd dokumentu
Metody hodowlane - Wykład 7 - strona 1 Metody hodowlane - Wykład 7 - strona 2 Metody hodowlane - Wykład 7 - strona 3

Fragment notatki:


METODY HODOWLANE METODY HODOWLANE - zagadnienia 1. Matematyczne podstawy metod hodowlanych 2. Wartość cechy ilościowej i definicje parametrów genetycznych 3. Metody szacowania parametrów genetycznych 4. Wartość hodowlana cechy ilościowej (ocena wartości hodowlanej na  podstawie różnych źródeł informacji, porównanie ich dokładności) 5. Indeks selekcyjny (łączenie źródeł informacji o wartości hodowlanej) 6. Eliminacja wpływów środowiska w ocenie wartości hodowlanej (metody  równoczesnego porównania, metoda BLUP metoda BLU ) 7. Selekcja i postęp hodowlany Eliminacja wpływów środowiska w ocenie wartości hodowlanej  Ocena buhaja na podstawie wydajności córek z różnych stad ijk j i ijk e s h y      P bY G   ˆ Model: Ocena: a n n b   2 2 2 4 h h a   W każdym modelu    jest zawsze  efektem stałym,  e  – zawsze  efektem losowym. Pozostałe ( h ,  s )  możemy uznać za stałe lub  losowe; mówimy wtedy o całym  modelu, że jest stały lub losowy.  efekt stały – jaki jest wpływ  konkretnych stad efekt losowy – jaki jest ogólnie wpływ ojcowski EFEKTY MODELU Przykład: jak zrobić drinki z kroplą tabasco? Jaki jest „efekt” tabasco  w naszych drinkach? Sposób 1: Rozlewamy  butelkę 0,5l do 5 szklanek i  do każdej dodajemy 1 kroplę tabasco Sposób 2:  Do butelki 0,5l  wpuszczamy 5 kropli tabasco,  mieszamy i rozlewamy do 5  szklanek. STAŁY LOSOWY MODEL MIESZANY W OCENIE WARTOśCI HODOWLANEJ  W modelach związanych z oceną wartości hodowlanej, np.:  ijk j i ijk e s h y      efekty stad czy  grup w modelu  to efekty stałe  oceniane wartości  hodowlane to  efekty losowe  Jest to tzw. model mieszany Skutek wieloletniego stosowania metod CC Trafny  wybór na  ojców Potomstwo  lepsze genetycznie Dokładna  ocena  buhajów Z roku na na rok  rośnie średnia  wartość hodowlana  populacji – pojawia  się trend genetyczny Trzeba dopasować model Populacja dzieli się na stada  i  istnieje trend genetyczny Populacja dzieli się na stada ijk j i ijk e s h y      ijkl jk j i ijkl e s a h y       a j  – efekt roku urodzenia buhaja Dodatkowy efekt genetyczny w modelu  ijkl jk j i ijkl e s a h y       efekt  a j  oznacza średnią wartość hodowlaną buhajów  urodzonych w roku  j . Jest to dodatkowy (oprócz efektu 

(…)


METODA BLUP – MACIERZ SPOKREWNIEŃ
Macierz spokrewnień A:
macierz symetryczna
 jej elementy aij to współczynniki pokrewieństwa
 jej elementy diagonalne ajj są równe 1 + wsp. inbredu
 jeśli rodzice osobnika j nie są spokrewnieni to ajj = 1
Przykłady prostych macierzy spokrewnień dla trzech osobników:
 1 0,5 0,5
A1  0,5 1 0,5


0,5 0,5 1 


0,25 0,25
 1
A 2  0,25
1
0,25


0,25 0,25…
… 
cov( g i g j )
 gi  g j
cov( g i g j )
2
g
Zatem: elementy macierzy spokrewnień to ilorazy kowariancji i
wariancji genetycznych, np.

 1

 cov g12
A
2
 g
 cov g13

2
g

cov g 21
2
g
1
cov g 23
2
g
cov g 31 

2
g 
cov g 32 

2
g 

1 

METODA BLUP – MACIERZ KOWARIANCJI
Jeśli pomnożymy macierz spokrewnień przez wariancję genetyczną
otrzymamy macierz kowariancji ocenianych…
… mieszanego, Mixed
Model Eguations, MME):
ˆ
X' Z
 X' X
 a   X' y 
 Z' X Z' Z  σ 2G 1  g   Z' y 
e


 ˆ  
gdzie macierz G to macierz kowariancji dla elementów wektora g.
MACIERZ KOWARIANCJI
Przypomnijmy sobie:

 1

 cov g12
2
A  g  
2
g

 cov g13

2
g

cov g 21
2
g
1
cov g 23
2
g
cov g 31 

2
g 
2
 g
cov g 32  2 
   g  cov g12
2
g 
cov g13


1 

2
G…
… MIESZANE W METODZIE BLUP
 Model ojcowski (Sire Model, SM)
yijk    hi  s j  eijk
yijkl    hi  a j  s jk  eijkl
 Model osobniczy (Animal Model, AM)
yij    hi  g j  eij
(zapis uproszczony)
gdzie gj – efekt genetyczny ocenianego osobnika
yij – jego wydajność (obserwacja),
eij – efekt specyficzny dla tej obserwacji,hi – efekt stada.
Są to modele mieszane: przyjmuje się, że hi i aj są efektami…
... zobacz całą notatkę

Komentarze użytkowników (0)

Zaloguj się, aby dodać komentarz