To tylko jedna z 3 stron tej notatki. Zaloguj się aby zobaczyć ten dokument.
Zobacz
całą notatkę
KWASY NUKLEINOWE
TRIPLEKSY, TERTAPLEKSY (KWADRUPLEKSY
TRIPLEKSY
mając w roztworze strukturę helisy DNA czy RNA albo strukturę mieszaną (1 nić DNA druga RNA - struktury istotne z punktu widzenia transkrypcji) mogą tworzyć się struktury tripleksu
w przypadku kiedy mamy do czynienia z jedną nicią homopurynową a drugą nicią homopirymidynową, czyli w sekwencjach nici mamy powtarzalne te same nukleotydy, albo specjalnie zaprojektowana sekwencja, która umożliwia utworzenie typu helisy potrójnej ze względu na odpowiednią komplementarność zasad
helisy potrójne mają szersze znaczenie biologiczne nawet dla DNA o dowolnej sekwencji, są to struktury przejściowo realizowane w przypadku rekombinacji ogólnej, czyli kiedy wymieniaja się fragmenty siąsiadujących chromosomów
taki układ jest stabilizowany przez białka
w strukturze tripleksu jeśli mamy jedną nić poli A, a drugą poli T czy poli U czy jedną RNA czy drugą DNA, mamy strukturę podwójnej helisy
do takiego układu AT może podejść trzecia nić od strony dużej bruzdy i utworzyć strukturę helisy potrójnej gdzie trzecia para jest stabilizowana przez tzw. Wiązania wodorowe typu Hoogsteena z udziałem adenozyny aminowej w 6-tej pozycji i azoty N7 , a w przypadku guanozyny z udziałem grupy ketonowej w 6 pozycji N7
dwa razy dwie helisy podwójne poliA i poli T mogą utworzyć poliT,poliA,poli T + pojedyncza nić poli A
odbywa się to pod wpływem dodawania jonów magnezu
w helisie potrójnej wszystkie 3 nici mają jednakowe własności konformacyjne
W takim ułożeniu, jak na rysunku, że tlen idzie za rysunek, węgiel do dołu, a zasada do góry, taką strukturę nazywamy strukturą β. Po odwróceniu otrzymalibyśmy nukleotyd α, ale takie nie występują w kwasach nukleinowych powstających naturalnie. Również struktura, jeśli chodzi o węgiel C4` jest to forma typu D, a więc cukrem, który stanowi element składowy nukleotydu w DNA to jest β2`deoksyrybopuranoza. STRUKTURA PIERWSZORZĘDOWA
W strukturze pierwszorzędowej jest zapisana cała informacja o strukturze, funkcjonowaniu i podziałach kom. Kwas deoksyrybonukleinowy budową bardzo przypomina kwas rybonukleinowy, ale różni się dość istotnie budową cząsteczki i funkcjami.Kiedy nukleotyd zostaje włączony w łańcuch otrzymujemy łańcuch fosfocukrowy złożony z reszt cukrowych połączonych mostkiem w postaci reszt fosforanowych? Grupa fosforanowa zawiera grupę OH z jednym odczepianym protonem. STRUKTURY TRZECIORZĘDOWE DNA
mniejszy polimorfizm struktur
jest to głównie nośnik materiału genetycznego
(…)
… A- minor
adenina oddziaływuje z komplementarną parą zasad typu GC
w GC mamy parowanie typu Watsona- i Cricka
adenozyna paruje z tą parą i powstają wiązania wodorowe
w typie i mamy do czynienia między grupą NH2 guaniny a akceptorem jest 3 azot adeniny
tlen cytozyny z grupą 2' OH adeniny
STRUKTURA II - RZĘDOWA
o formie II-rzędowej helisy decyduje: > sekwencja zasad (naprzemienne sekwencje umożliwiają utworzenie struktury)
> warunki środowiska: temp, pH, siła jonowa zmieniając warunki możemy powodować przechodzenie jednej formy w drugą, rozpad i powrót do formy helikalnej
> denaturacja topnienie helis - wąski zakres temp. Topnienia ;50% w formie helikalnej i 50% w formie 2 nici)
stabilizacja przez oddziaływania warstwowe, ze środowiskiem i między sobą
hypochromazja - podwyższenie absorbcji. 2…
... zobacz całą notatkę
Komentarze użytkowników (0)