To tylko jedna z 3 stron tej notatki. Zaloguj się aby zobaczyć ten dokument.
Zobacz
całą notatkę
AMINOKWASY NIEBIAŁKOWE
-alanina - składnik dipeptydów karnozyny i anseryny oraz kwasu pantotenowego budującego koenzym A
Ornityna, cytrulina - uczestniczą w przebiegu cyklu mocznikowego
Kwas aminomasłowy - przekaźnik sygnałów w centralnym układzie nerwowym
RZADKO WYSTĘPUJĄCE W BIAŁKACH (przetworzone potranslacyjnie)
5-hydroksylizyna, 4-hydroksyprolina, lizyna
Są charakterystyczne dla kolagenu i elastyny, nie mają własnych kodów, są wynikiem przemian potranslacyjnych.
Wg Karlsona
Z apolarnym łańcuchem bocznym
Z polarnym łańcuchem bocznym (bez ładunku)
Monoaminodikarboksylowe (naładowane ujemnie)
Diaminomonokarboksylowe (naładowane dodatnio)
Wg przemian glukogenne
szlak kwasu pirogronowego (acetylo-CoA) - treonina, glicyna, seryna, cystyna, cysteina, alanina
szlak kwasu glutaminowego ( i ketoglutaranu) - arginina, prolina, histydyna, glutamina
szlak kwasu bursztynowego
szlak kwasu szczawiooctowego - asparagina, kwas asparaginowy
ketogenne
szlak acetylo-CoA - leucyna
Mieszane
Izoleucyna, lizyna, tyrozyna, fenyloalanina
Wg udziału w strukturach wtórnych białek
stabilizujące -helisę - aminokwasy z łańcuchem bocznym nie polarnym (bez proliny)
destabilizujące -helisę - glutaminian, asparaginian, histydyna, lizyna, arginina, tryptofan , izoleucyna przerywające -helisę - prolina, hydroksyprolina
Reakcje grupy aminowej
Z kwasem azotowym - powstaje azot i następuje zamiana grupy aminowej na hydroksylową (mierzenie ilości azotu, ilościowa ocena aminokwasów metodą van Slyke'a)
N-acylowanie halogenkami lub bezwodnikami kwasowymi - powstające w reakcji N-acyloaminokwasy stanowią ochronę grup aminowych w syntezie peptydów
3. N-alkilowanie, metylowanie - powstają betainy odpowiadające kwasom aminokwasowym, donorem jest adenocylometionina (reakcja ninhydrynowa)
Reakcja Sangera z fluoronitrobenzenem
- znakowanie i oznaczanie grup aminowych w aminokwasach i peptydach
Reakcja Edmana z fenyloizotiacjanianem
- oznaczanie grup aminokwasowych końcowych aminokwasów w łańcuchach polipeptydowych
Etapy oznaczania sekwencji aminokwasów
Identyfikacja reszt aminokwasowych NH 2 i COOH końcowego
Hydroliza łańcucha polipeptydowego pod działaniem trypsyny = cięty na mniejsze fragmenty, elektroforeza
Podział elektroforetyczny lud chromatograficzny uzyskanych fragmentów oraz identyfikacja NH 2 i COOH końcowych aminokwasów
Stopniowa degradacja Edmana
... zobacz całą notatkę
Komentarze użytkowników (0)