Badanie genomu metodą analizy sprzężeń - ćwiczenia 2

ZADANIA DO WYKONANIA    1.   Na podstawie danych z pliku  dane.txt   (z  poprzednich  zajęć)  obliczyć  frekwencje  poszczególnych alleli dla każdego z markerów.  2.   Przedstawić frekwencje alleli na stosownym wykresie.  3.   Wyznaczyć i przedstawić na stosownym wykresie wartości MAF.      PRACA Z PROGRAMEM  EMLD    4.   Utworzyć  na  dysku  komputera  katalog  o  nazwie  EMLD  i  umieścić  w  nim  pliki  otrzymane drogą mailową.  5.   Zapoznać  się  z  instrukcją  obsługi  programu  EMLD,  a  w  szczególności  ze  strukturą  pliku wejściowego.  6.   Sprawdzić działanie programu na przykładowym pliku wejściowym  TEST.dat  (Jeżeli  na  komputerze  nie  ma  zainstalowanego  oprogramowania  JAVA,  wejść  na  stronę  http://java.com/pl/download/index.jsp  oraz zainstalować program.)  7.   Przeanalizować pliki wyjściowe. Jak się nazywają? Co zawierają?  8.   Z pliku  doEMLD.txt   utworzyć  plik  wejściowy  do  programu  EMLD  oraz  przeanalizować  go  z  jego  użyciem.  DOBRA  WIADOMOŚĆ:  program  działa  też  dla  pliku wejściowego z rozszerzeniem  txt    9.   Zinterpretować wyniki i zapisać wnioski.  ... zobacz całą notatkę