To tylko jedna z 19 stron tej notatki. Zaloguj się aby zobaczyć ten dokument.
Zobacz
całą notatkę
BIOPERL WSTĘP 1. Katedra Genetyki 2. Tematyka przedmiotu 3. Charakterystyka wykładów 4. Charakterystyka ćwiczeń 5. Informacje i kontakt 6. Literatura KATEDRA GENETYKI Katedra Genetyki i Ogólnej Hodowli Zwierząt: http://gen.edu.pl KATEDRA GENETYKI Grupa Genetyki Statystycznej: http://theta.edu.pl GŁÓWNE KIERUNKI BADAŃ 1. Detekcja genów • efekty epistazy • efekt genu stały i zmienny w czasie • konstrukcja sieci genów 2. Modelowanie fenotypowej zmienności cech • obliczanie tradycyjnej i genomowej wartości hodowlanej 3. Analiza sekwencji DNA BIOPERL Co to jest PERL ??? • Linux • Perl • Bioperl 1. System operacyjny, 1991 2. Linus Thorvalds Richard Stallman jądro, ang. Kernel powłoki, ang. shells Helsinki Massachusetts 3. Darmowy Internet BIOPERL 1. Język programowania, 1987, Larry Wall 2. Practical Extraction and Report Language 3. Zastosowania • Zarządzanie plikami i procesami w systemach Unix, Linux • Przetwarzanie tekstów 4. Zalety • Łatwy • Szybki • Darmowy BIOPERL 1. Zespół modułów napisanych w języku Perl 2. Analiza danych biologicznych 3. Darmowy BIOPERL 1. Wyjaśnienie i praktyczna prezentacja tematyki realizowanej na ćwiczeniach 2. Obecność 3. Pytania CHARAKTERYSTYKA WYKŁADÓW 1. Praca samodzielna przy komputerze → tworzenie programów 2. Obecność 3. Zaliczenie (bez poprawek) 4. Indywidualny projekt programistyczny 5. 2 kolokwia przy komputerze CHARAKTERYSTYKA ĆWICZEŃ • Wstęp • Wprowadzenie do pracy w systemie operacyjnym Linux x 2 • Wprowadzenie do programu Perl x 8 • Wprowadzenie do programu Bioperl x 3 • Zaliczenie CHARAKTERYSTYKA WYKŁADÓW I ĆWICZEŃ KONTAKT konsultacje: indywidualnie / forum / skype termin ustalony indywidualnie z prowadzącym adres: Katedra Genetyki Kożuchowska 7 KONTAKT informacje: http://www.up.wroc.pl/~szyda Bioperl KONTAKT informacje: http://theta.edu.pl/teaching/ Bioperl LITERATURA LINUX
... zobacz całą notatkę
Komentarze użytkowników (0)