BioPerl - wykład 1

Nasza ocena:

5
Pobrań: 21
Wyświetleń: 1827
Komentarze: 0
Notatek.pl

Pobierz ten dokument za darmo

Podgląd dokumentu
BioPerl - wykład 1 - strona 1 BioPerl - wykład 1 - strona 2 BioPerl - wykład 1 - strona 3

Fragment notatki:


BIOPERL                                         WSTĘP      1. Katedra Genetyki  2. Tematyka przedmiotu  3. Charakterystyka wykładów  4. Charakterystyka  ćwiczeń  5. Informacje i kontakt  6. Literatura  KATEDRA   GENETYKI   Katedra Genetyki i Ogólnej Hodowli Zwierząt: http://gen.edu.pl     KATEDRA   GENETYKI   Grupa Genetyki Statystycznej:   http://theta.edu.pl     GŁÓWNE KIERUNKI BADAŃ   1. Detekcja genów  • efekty epistazy  • efekt genu stały i zmienny w czasie  • konstrukcja sieci genów  2. Modelowanie fenotypowej zmienności cech  • obliczanie tradycyjnej i genomowej wartości  hodowlanej  3. Analiza sekwencji DNA  BIOPERL      Co to jest PERL ???   • Linux  • Perl  • Bioperl  1. System operacyjny, 1991  2. Linus Thorvalds      Richard Stallman     jądro, ang. Kernel      powłoki, ang. shells               Helsinki          Massachusetts   3. Darmowy  Internet    BIOPERL      1. Język programowania, 1987, Larry Wall  2. Practical Extraction and Report Language  3. Zastosowania  • Zarządzanie plikami i procesami w systemach Unix,  Linux  • Przetwarzanie tekstów  4. Zalety  • Łatwy  • Szybki  • Darmowy     BIOPERL   1. Zespół modułów napisanych w języku Perl  2. Analiza danych biologicznych  3. Darmowy  BIOPERL      1. Wyjaśnienie i praktyczna prezentacja tematyki  realizowanej na ćwiczeniach  2. Obecność  3. Pytania  CHARAKTERYSTYKA    WYKŁADÓW     1. Praca samodzielna przy komputerze  →  tworzenie programów  2. Obecność  3. Zaliczenie (bez poprawek)  4. Indywidualny projekt programistyczny  5. 2 kolokwia przy komputerze     CHARAKTERYSTYKA    ĆWICZEŃ  •  Wstęp          •  Wprowadzenie do pracy w systemie operacyjnym Linux x 2  •  Wprowadzenie do programu Perl x 8  •  Wprowadzenie do programu Bioperl x 3  •  Zaliczenie     CHARAKTERYSTYKA    WYKŁADÓW   I   ĆWICZEŃ     KONTAKT  konsultacje:  indywidualnie / forum / skype            termin ustalony indywidualnie z prowadzącym  adres:      Katedra Genetyki            Kożuchowska 7     KONTAKT  informacje:  http://www.up.wroc.pl/~szyda   Bioperl     KONTAKT  informacje:  http://theta.edu.pl/teaching/     Bioperl  LITERATURA                         LINUX  ... zobacz całą notatkę



Komentarze użytkowników (0)

Zaloguj się, aby dodać komentarz