Badanie struktury białka

określanie struktury II-rzędowej

Pomiar dichroizmu kołowego CD

dichroizm kołowy CD jest to zjawisko polegające na rożnej absorpcji przez substancje światła spolaryzowanego kołowo prawoskrętnie i lewoskrętnie

Białka i peptydy absorbują światło spolaryzowane Oznaczenie zawartości -helisy w białkach wykonane na podstawie widm CD są zgodne z wynikami uzyskanymi na podstawie badan krystalografii rentgenowskiej.

Za pomocą dichroizmu kołowego można również oznaczyć zawartość struktur  w białku, ale z mniejsza dokładnością

Pomiary CD wykonuje się w zakresie UV od 170 do 240 nm, ponieważ w tym regionie grupy amidowe peptydów maja liczne, nakładające się pasma absorpcji.

Na podstawie pomiarów CD syntetycznych polipeptydów i białek o znanej strukturze określono widma CD dla helisy , struktur  i przypadkowego kłębka. helisy (+)192nm, (0) 200nm, (-) 208 , (-) 222 struktury  (+) 200 nm, (0) 207 nm, (-) 217nm przypadkowego kłębka (-) 200 nm,

Widmo CD zależy od siły jonowej i rodzaju roztworu, w którym się znajduje. można tez badac zmiany konformacyjne w białkach jako funkcje temperatury, pH, rozpuszczalnika oddziaływania typu: białko-białko czy białko-inhibitor