To tylko jedna z 12 stron tej notatki. Zaloguj się aby zobaczyć ten dokument.
Zobacz
całą notatkę
Aminokwasy
A i k
elementy budulcowe białek
1/37
Schemat biogenetycznego podziału
aminokwasów białkowych na rodziny
Orn – ornityna, Hom – homoseryna
2/37
Rodzina asparaginianowa
Szczawiooctan
Asparaginian
A
i i
Asparagina
Metionina
Treonina
Lizyna
Izoleucyna
y
3/37
Rodzina szikimianowa
Fosfoenolopirogronian
+
Erytrozo-4-fosforan
y
Fenyloanalina
Tyrozyna
Tryptofan
Tyrozyna
4/37
Rodzina pirogronianowa
Rodzina glutaminianowa
Ketoglutaran
Glutaminian
Pirogronian
Alanina
Walina
Leucyna
Glutamina
Prolina
Arginina
Rodzina ser no a
Rod ina serynowa
3 fosfoglicerynian
3-fosfoglicerynian
Rybozo 5 fosforan
Rybozo-5-fosforan
Seryna
Histydyna
Cysteina
Glicyna
5/37
Metabolizm aminokwasów
wejście szkieletów węglowych AK do cyklu Krebsa
6/37
Metabolizm aminokwasów
7/37
Właściwości aminokwasów białkowych
(1) oddziaływanie reszty aminokwasowej z wodą
dd i ł
i
t
i k
j
d
wyrażone w kcal/mol
Nr
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
Aminokwas
Arginina
Asparaginowy kwas
Lizyna
Glutaminowy kwas
Asparagina
Glutamina
Histydyna
Tyrozyna
Prolina
Seryna
Glicyna
Treonina
Alanina
Tryptofan
Cysteina
C t i
Walina
Leucyna
Izoleucyna
Metionina
M ti i
Fenyloalanina
Symbol
trójliterowy
Symbol
jednoliterowy
Energia oddziaływania
łańcucha bocznego z H2O
Lokalizacja
w białku
Arg
Asp
Lys
Glu
Asn
Gln
His
Tyr
Pro
Ser
Gly
Thr
Ala
Trp
Cys
C
Val
Leu
Ile
Met
M t
Phe
R
D
K
E
N
Q
H
Y
P
S
G
T
A
W
C
V
L
I
M
F
-12,3
-9,2
-8,8
88
-8,2
-4,8
-4,1
-3,0
30
-0,7
-0,2
0,6
1,0
10
1,2
1,6
1,9
2,0
20
2,6
2,8
3,1
3,4
34
3,7
zew
zew
zew
zew
zew
zew
zew
mix
mix
mix
mix
mix
mix
mix
mix
i
wew
wew
wew
wew
wew
(–) wydziela się energia; (+) energia jest pobierana
8/37
Właściwości aminokwasów białkowych
(2) cechy reszt aminokwasowych w strukturze bi ł k
h
i k
h
k
białek
Nr
**
Aminokwas
Lokalizacja
w białku
Ruchliwość
Natura chemiczna
ruchliwy
Rozmiar
Polarność
zasada
polarny posiada ładunek (+)
hydrofilowy
ruchliwy
kwas karboksylowy
polarny posiada ładunek (–)
hydrofilowy
Ładunek
Interakcja
z H2O
1 Arginina
zew
2 Asparaginowy kwas
zew
3 Lizyna
zew
ruchliwy
zasada
polarny posiada ładunek (+)
hydrofilowy
4 Glutaminowy kwas
zew
ruchliwy
kwas karboksylowy
polarny posiada ładunek ( )
(–)
hydrofilowy
5 Asparagina
zew
ruchliwy
amid kwasowy
polarny
6 Glutamina
zew
ruchliwy
amid kwasowy
polarny
7 Histydyna
zew
ruchliwy
zasada
8 Tyrozyna
mix
9 Prolina
mix
10 Seryna
mix
bardzo mały ruchliwy
y
11 Glicyna
mix
bardzo mały ruchliwy węglowodór alifatyczny ( )
y
y
ęg
y
y (?)
12 Treonina
mix
13 Alanina
mix
14 Tryptofan
mix
mały
15 Cysteina
mix
mały
16 Walina
wew
mały
17 Leucyna
mały
mały
polarny posiada ładunek (+) hydrofobowy
fenol
węglowodór alicykliczny
mały
mały
0/+
nie
alkohol
posiada ładunek (–)
hydrofobowy
polarny
bardzo mały ruchliwy
ruchliwy
hydrofobowy
y
y
alkohol
polarny
hydrofobowy
węglowodór alifatyczny
nie
hydrofobowy
węglowodór heterocykliczny
ruchliwy
nie
nie
(…)
…
97,0
12,0
12 0
0,5
70,0
mix
zew
zew
zew
mix
wew
mix
zew
zew
zew
wew
wew
zew
wew
mix
mix
mix
mix
mix
wew
pKa – ujemne l
K
j
logarytmy stałych
ł h
kwasowości:
(K) – grupa kwasowa,
(Z) – grupa zasadowa,
„2” – stała dysocjacji dodatkowej
g py
grupy kwasowej lub p y ą
j
przyłączenie dodatkowego jonu H+
do grupy zasadowej (Z);
pI – punkt izoelektryczny;
S – rozpuszczalność w wodzie
w temperaturze 25°C
25 C…
... zobacz całą notatkę
Komentarze użytkowników (0)