Genomika i proteomika - wykład 4

Nasza ocena:

5
Pobrań: 112
Wyświetleń: 1323
Komentarze: 0
Notatek.pl

Pobierz ten dokument za darmo

Podgląd dokumentu
Genomika i proteomika - wykład 4 - strona 1 Genomika i proteomika - wykład 4 - strona 2 Genomika i proteomika - wykład 4 - strona 3

Fragment notatki:


                Genomika porównawcza  Ostatnio:  Co to jest mapa genomowa ?  Po co tworzymy mapy genomowe ?   Jakie znacie rodzaje map genomowych ?   Która metoda mapowania genomów jest  najlepsza i dlaczego ?  Sekwencjonowanie genomów cz. 1  Dziś:  Sekwencjonowanie genomów  Cel sekwencjonowania DNA:    poznanie pełnej sekwencji nukleotydowej  określonego fragmentu DNA – w konsekwencji  poznanie sekwencji nukleotydowej całego  genomu  Pierwsze wydajne i skuteczne metody  sekwencjonowania opracowano w latach 70- tych dwudziestego wieku  Sekwencjonowanie genomów  Walter Gilbert,   source:http://www.nlm.nih.gov/visiblep roofs/media/gallery/vi_a_209.jpg  Metoda Maxama- Gilberta  W latach 1976-77 Allan Maxam  i Walter Gilbert opracowali  metodę sekwencjonowania  opartą o chemiczną  modyfikację DNA   Sekwencjonowanie genomów  W metodzie Maxama-Gilberta istotą  sekwencjonowania nie jest synteza ale chemiczna  degradacja DNA.  Degradacja jest dwustopniowa.   Reakcja rozpoczyna się od wyznakowania DNA.   Następnie dodaje się siarczan dimetylu (dla puryn) lub  hydrazyny (dla pirmidyn).  Na końcu zaś piperdynę, która katalizuje cięcie nici  DNA w obrębie wiązania fosfodiestrowego  Sekwencjonowanie genomów  Metoda Maxama-Gilberta pierwotnie była  bardziej popularna niż metoda terminacji  łańcucha.  Jednak w miarę  rozwoju aparatury i  automatyzacji procesu wymyślonego przez  Sangera przestano jej używać i dziś nie jest już  wykorzystywana w praktyce.  Sekwencjonowanie genomów  source:  http://www.nlm.nih.gov/visibleproofs/media/g allery/vi_a_208b.jpg  Frederic Sanger  dwukrotny noblista   -- za ustalenie struktury insuliny  (1958)  -- za opracowanie metody  sekwencjonowania (1980)  W 1975 roku opracował  metodę sekwencjonowania  zwaną metodą terminacji  łańcucha lub metodą Sangera  Sekwencjonowanie genomów  Metoda Sangera opiera się na syntezie nowej nici DNA  przy użyciu dideoksynukleotydów – powstających z  dideoksyrybozy, która nie posiada grup  hydroksylowych  Sekwencjonowanie genomów  Przyłączenie tak zmodyfikowanego nukleotydu  powoduje zakończenie procesu syntezy DNA  Sekwencjonowanie genomów  Pierwotnie w celu odczytu sekwencji primery  znakowano specjalnymi znacznikami  fluorescencyjnymi, które przy odczycie sekwencji  świeciły.  Obecnie znakowane są już same blokery –  dideoksynukleotydy.  Sekwencjonowanie genomów  Odczyt sekwencji następuje przy użyciu sekwenatorów  kapilarnych, które obecnie są w pełni zautomatyzowane  ... zobacz całą notatkę

Komentarze użytkowników (0)

Zaloguj się, aby dodać komentarz