Identyfikacja mikroorganizmów Proces identyfikacji organizmu polega na określeniu przynależności badanego organizmu do organizmu do odpowiedniej jednostki taksonomicznej, najczęściej gatunku.
Szczep referencyjny - izolant danego gatunku opisany jako pierwszy i najlepiej scharakteryzowany
Gatunek - grupa szczepów w tym szczep referencyjny wykazując y co najmniej 70% homologii pełnego genomowego DNA; grupa szczepów różniąca się G+C w genomowym DNA nie więcej niż 3% molowe dla prokariotów : - Metody klasyczne: morfologia komórki, skład chemiczny ściany komórkowej, obecność inkluzji komórkowej i substancji zapasowych, zdolność do tworzenia pigmentów, wymagania pokarmowe, skład i ilość produktów fermentacji, stosunek do tlenu, charakterystyka temperaturowa, pH, wrażliwość na antybiotyki, patogenność, środowisko występowania, interakcje z innymi organizmami. - Metody biologii molekularnej: analiza ilościowa kwasów nukleinowych (% G+C) , homologia kwasów nukleinowych (metoda hybrydyzacji) dla eukariota:
-metody klasyczne: sposób rozmnażania generatywnego, morfologia komórki, sposób rozmnażania wegetatywnego, cechy hodowlane populacji, tworzenie pigmentu, tworzenie pseudogrzybni/grzybni właściwej, tworzenie ureazy, wymagania pokarmowe, osmotolerancyjność i osmofilność, budowa ściany komórkowej, ekologia, patogenność - Metody biologii molekularnej: analiza ilościowa kwasów nukleinowych (% G+C) , homologia kwasów nukleinowych
metody biochemiczne:
- określenie zdolności mikroorganizmów do asymilacji, fermentacji, rozkładu zw chemicznych ( cechy biologiczne określa się na podstawie reakcji w odpowiednich pożywkach, odczyt: gapimy się ) metody biofizyczne: - identyfikacja taksonomiczna przez oznaczanie produktów ich metabolizmu lub wybranych związków wchodzących w skład struktur komórkowych (elektroforetyczne-skład białek charakterystyczny dla danej jednostki taksonomicznej i chromatograficzne-skład kw tłuszczowych ściany kom )
homologia 60% - gatunek, homologia 20% - rodzaj metody immunologiczne: reakcja przeciwko przeciwciałem i antygenem, testy aglutynacyjne , testy immunofluorescencyjne (przeciwciała znakowane barwinkami), testy immunoenzymatyczne (reakcje enzymatyczne), ELISA, Identyfikacja mikroorganizmów
Proces identyfikacji mikroorganizmów polega na określeniu przynależności badanego organizmu do odpowiedniej jednostki taksonomicznej, najczęściej gatunku.
Szczep referencyjny - izolant danego gatunku, opisany jako pierwszy i najlepiej scharakteryzowany (wzorzec).
Gatunek - grupa szczepów, w tym szczep referencyjny, wykazujący co najmniej 70% homologii pełnego genomowego DNA.
(…)
…), gatunki osmotolerancyjne (tolerują duże stężenia soli nieorganicznych (20%), stężenie glukozy=50%- kiszonki, marynaty)
Źródło węgla: organiczne (monosacharydy, disacharydy, tri sacharydy), alkohole (etanol, metanol, etanodiol, glicerol), poliole (rybitol, galacticol), kw. Organiczne, niekonwencjonalne
Źródło azotu: pepton, ekstrakt drożdżowy, brzeczka, sole nieorganiczne (fosforan amonu), aminokwasy…
… niedoskonałe) - np. Aspergillius(kropidlak), Penicillium (pędzlak) , Fusarium, Botrytis (gronkowiec szary), Alternaria, Cladosporium, Geotrichum Glaucus, A. Niger => mała zawartość wody
Ochraceus, A. Oryzae, A. Flavus, A.Parasiticus =>zboża, nasiona, orzechy
Niger, A. flavus, A.oryzae => ściany, materiały budowlane
Niger=> produkcja kw. Cytrynowego - rozmnażanie: wegetatywne, cykl pseudoseksualny…
... zobacz całą notatkę
Komentarze użytkowników (0)